I havet utanför Kretas kust finner marinarkeologen Jack Howard en skiva av guld med tecken från tidig minoisk kultur. Samtidigt finner man vid utgrävningar i Nineveöknen pergamentskrifter som berättar om en kultplats som sjönk i havet för tusentals år sedan. Tillsammans avslöjar tecknen Atlantis hemlighet. Men ett gäng pirater är också intresserad av fyndet.